Análises integradas de serum e urina-omics em ADPKD como uma fonte de biomarcadores e insights mecânicos

Título do projeto:

Análises de serum e urina-ómicas integradas na doença renal policística autossómica dominante (ADPKD) como uma fonte de biomarcadores e insights mecanísticos

Objetivos:

• Analisar o proteoma urinário utilizando espectrometria de massa (MS) a partir da coorte AD(H)PKD alemã, que inclui aproximadamente 2.100 amostras. Realizar limpeza de dados, normalização, imputação e correção de efeito de lotes.
• Identificar proteínas urinárias associadas ao declínio do eGFR usando wLASSO e LIMMA, os métodos computacionais, e explorar funções biomoleculares associadas implicadas na progressão da ADPKD.
• Determinar a capacidade preditiva das proteínas associadas à inclinação da eGFR e estabelecer o seu valor acrescentado em modelos multivariados que integram variáveis clínicas e ferramentas de previsão de ponta (ou seja, eGFR, idade, sexo, MIC, genótipo, pontuação PRO-PKD).

Resultados:

• Mais de dois mil proteínas foram detetadas em amostras de urina de pacientes com ADPKD, e após normalização, mais de mil e quinhentas proteínas permaneceram para análise adicional.
• Vinte proteínas foram mais fortemente associadas ao declínio do eGFR, e as suas funções moleculares indicam principalmente adesão epitelial renal e a perda da integridade estrutural.
• O modelo multivariado baseado no proteoma urinário demonstra um desempenho superior em comparação com o modelo clínico (r²=0,32 vs r²=0,22). Além disso, a integração dos métodos atuais de progressão da ADPKD com proteínas urinárias melhora a capacidade preditiva (r²=0,37 vs r²=0,32).