Интегрированный анализ сыворотки и мочи-омикс в ADPKD в качестве источника биомаркеров и механистических взглядов

Название проекта:

Интегрированный анализ сыворотки и мочи-омикс при автосомно-доминантной поликистозной болезни почек (АДПКБ) в качестве источника биомаркеров и понимания механизмов заболевания

Цели:

• Проанализировать уринарный протеом с использованием масс-спектрометрии (МС) от немецкой когорты AD(H)PKD, которая включает около 2,100 образцов. Выполнить очистку данных, нормализацию, метод импутации и корректировку батч-эффекта.
• Выявить уринарные белки, связанные с ухудшением eGFR, используя wLASSO и LIMMA, вычислительные методы, и исследовать ассоциированные биомолекулярные функции, имеющие место при прогрессировании ADPKD.
• Определить прогностическую способность белков, связанных с уклоном eGFR, и установить их дополнительную ценность в многомерных моделях, интегрирующих современные клинические переменные и инструменты прогноза (т.е., eGFR, возраст, пол, MIC, генотип, балл PRO-PKD).

Результаты:

• Более двух тысяч белков были обнаружены в образцах мочи пациентов с ADPKD, и после нормализации для дальнейшего анализа осталось свыше пятнадцати сотен белков.
• Двадцать белков наиболее сильно ассоциированы с ухудшением eGFR, и их молекулярные функции в основном указывают на адгезию почечного эпителия и нарушение структурной целостности.
• Многомерная модель, основанная на уринарном протеоме, показывает более высокую эффективность по сравнению с клинической моделью (r²=0.32 против r²=0.22). Более того, интеграция текущих методов прогнозирования прогрессирования ADPKD с уринарными белками увеличивает прогностическую способность (r²=0.37 против r²=0.32).