Análisis integrados de suero y orina-ómicos en ADPKD como fuente de biomarcadores y conocimiento mecanicista

Título del proyecto:

Análisis integrados de suero y orina-ómicos en la enfermedad renal poliquística autosómica dominante (ADPKD) como fuente de biomarcadores y conocimiento mecanístico

Objetivos:

• Analizar el proteoma urinario utilizando espectrometría de masas (MS) de la cohorte alemana AD(H)PKD, que incluye aproximadamente 2.100 muestras. Realizar limpieza de datos, normalización, imputación y corrección de efecto de lote.
• Identificar las proteínas urinarias asociadas con el descenso del eGFR utilizando wLASSO y LIMMA, los métodos computacionales, y explorar las funciones biomoleculares asociadas implicadas en la progresión de la ADPKD.
• Determinar la capacidad predictiva de las proteínas asociadas a la pendiente del eGFR y establecer su valor añadido en modelos multivariantes que integran variables clínicas de vanguardia y herramientas de predicción (es decir, eGFR, edad, sexo, MIC, genotipo, puntuación PRO-PKD).

Resultados:

• Se detectaron más de dos mil proteínas en las muestras de orina de pacientes con ADPKD, y después de la normalización, más de mil quinientas proteínas permanecieron para el análisis posterior.
• Veinte proteínas estaban más fuertemente asociadas con el descenso del eGFR, y sus funciones moleculares indican principalmente la adhesión epitelial renal y la descomposición de la integridad estructural.
• El modelo multivariable basado en el proteoma urinario muestra un rendimiento superior en comparación con el modelo clínico (r²=0.32 vs r²=0.22). Además, la integración de los métodos actuales de progresión de la ADPKD con las proteínas urinarias mejora la capacidad predictiva (r²=0.37 vs r²=0.32).