Analyses intégrées du sérum et de l’urine-omiques dans l’ADPKD comme source de biomarqueurs et d’aperçu mécaniste

Titre du projet :

Analyses intégrées du sérum et de l’omics urinaire dans la maladie rénale polykystique autosomique dominante (ADPKD) comme source de biomarqueurs et d’informations mécanistiques

Objectifs :

• Analyser le protéome urinaire à l’aide de la spectrométrie de masse (MS) à partir de la cohorte allemande AD(H)PKD, qui comprend environ 2 100 échantillons. Effectuer le nettoyage des données, la normalisation, l’imputation et la correction des effets de lot.
• Identifier les protéines urinaires associées au déclin de l’eGFR à l’aide de wLASSO et LIMMA, les
  méthodes de calcul, et explorer les fonctions biomoléculaires associées impliquées dans
  la progression de l’ADPKD.
• Déterminer la capacité prédictive des protéines associées à la pente de l’eGFR et établir leur valeur ajoutée dans des modèles multivariés intégrant les variables cliniques de pointe et
  les outils de prévision (c’est-à-dire, eGFR, âge, sexe, MIC, génotype, score PRO-PKD).

Résultats :

• Plus de deux mille protéines ont été détectées dans les échantillons d’urine des patients atteints d’ADPKD, et après normalisation, plus de quinze cents protéines sont restées pour une analyse plus approfondie.
• Vingt protéines étaient les plus fortement associées au déclin de l’eGFR, et leurs fonctions moléculaires indiquent principalement l’adhérence de l’épithélium rénal et la dégradation de l’intégrité structurelle.
• Le modèle multivarié basé sur le protéome urinaire montre une performance supérieure par rapport au modèle clinique (r²=0,32 vs r²=0,22). De plus, l’intégration des méthodes actuelles de progression de l’ADPKD avec les protéines urinaires améliore la capacité prédictive (r²=0,37 vs r²=0,32).