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Identification de nouveaux gènes dans les pedigrees de type ADPKD

Projet de Recherche G&K

Nikola Zagorec

Pays d’origine:
Croatie

Université d’accueil:
Division de Néphrologie, Centre de Référence pour les Maladies Rénales Héréditaires (MARHEA), CHRU Brest, France

Période de bourse:
Novembre 2023 – Novembre 2024

Activité

Objectifs:

  • Analyser les données de séquençage de l’exome entier d’individus atteints de la polykystose rénale autosomique dominante (ADPKD) qui sont restés génétiquement non résolus après l’application d’un panel de gènes pour les reins kystiques, afin d’identifier de nouveaux candidats pour des gènes kystiques et des phénotypes de rein kystique.
  • Évaluer les caractéristiques cliniques et radiologiques des individus génétiquement non résolus atteints de ADPKD en lien avec les antécédents familiaux et les résultats génétiques.
  • Explorer la prévalence génétique et la pénétrance des gènes associés à la ADPKD en utilisant des bases de données de population (gnomAD) et de grands ensembles de données génomiques basées sur les patients (Genomics England 100k Genomes Project).
  • Analyser le phénotype clinique des patients présentant des présentations atypiques de la ADPKD classique (par exemple, la ADPKD liée à des variantes pathogènes monoalléliques dans IFT140, ALG5 et ALG6).

Résultats:

  • ADPKD et le spectre de type ADPKD représentent un groupe génétiquement hétérogène de maladies, impliquant plus de 20 gènes (10 gènes kystiques et plus de 10 phénocopies de ADPKD).
  • Les variantes monoalléliques de perte de fonction prédites dans IFT140 sont la troisième cause génétique la plus fréquente de la ADPKD, généralement associées à une présentation atypique et à un pronostic rénal favorable.
  • Les variantes monoalléliques dans un gène candidat en cours de caractérisation phénotypique peuvent également entraîner une ADPKD avec des caractéristiques atypiques rappelant la maladie associée à IFT140.